Puuuh, ziemlicher Weichensalat...
Den zu signalisieren ist nicht einfach.
Zunächst mal hast du den Fehler gemacht, mehrere Signallinks für denselben fahrweg zu verlegen.
Ich hab mal einen solchen Fall hier markiert.

Auch solltest du darauf achten, entweder die darauf folgende Weiche noch mitzunehmen, oder dort ein Zwischensignal zu setzen.
Praxistipp:
Sich am Standort des Signals hinstellen und alle möglichen Fahrwege erstmal analysieren und durchzählen. Dann das passende Signal setzen und gucken, dass man nicht stumpf in eine ungesicherte Weiche brettern kann. Signallinks bilden also Fahrwege und das erklärt auch, warum das doppelte verlegen im Bild oben nicht korrekt ist. Der vordere Link muss also einen alternativen fahrweg schützen, nicht den, den der hintere Link bereits abdeckt.
Übrigens können Gleistrennungen auch manuell vorgenommen werden, dazu das "Auftrennen" Werkzeug benutzen und dann wieder verschweißen. Du musst also nicht zwingend nur die Trennungen nehmen, die du beim Verlegen (zufällig) hast.
Die 6-fach-Kreuzung muss vernünftig gebildet sein mit Radlenkern, etc. Ist sie das? Wenn nicht, erkennt ein Signal einen belegten Block nicht und kreuzende Züge könnten kollidieren.