Also wenn deine GPU öfters mal Heiß läuft dann würde ich mir mal Gedanken machen woran das liegen könnte. Als erstes mal aufmachen und alle Komponenten Gründlich vom Staub befreien. Wie sieht deine Gehäusebelüftung aus. Eventuell kann/muss ein Gehäuselüfter nachgerüstet werden.
Die Installationsdateien liegen hier; *:\...\Steam\SteamApps\common\railworks
Backup wiederherstellen reicht vollkommen bei einer Neu-Installation.
Alles was auf rwp oder rpk endet wird mit dem Paketmanager Installiert, alles andere wird ins Verzeichnis Kopiert. Eine Installationsanleitung liegt in der Regel bei allen Downloads bei.
Zu deinen restlichen Fragen empfehle ich dir die Handbücher unter *:\...\Steam\SteamApps\common\railworks\Manuals\DE
RW Driver Manual_Web.pdf
RW Keyboard Signal Guide_Web.pdf
RW Quickstart Guide_Web.pdf
Da steht alles drin (in Deutsch) was man als "Anfänger" Wissen sollte. 
Gruß, Jim