Egal welcher Wegpunkt oder ein bestimmter?
Das kenne ich zu gut. Ich machs immer so: Wegpunkt setzen, Speichern mit F2, Wegpunkt setzen usw... sobald das Spiel dann abstürzt, lade ich es erneut und mache dann genau so weiter. Bei langen Strecken geht das zwar sehr auf den Keks, dafür ist aber nicht die Arbeit dahin.
Mal einem Log erstellen lassen? Siehe: https://www.railsimulator.net/lexicon/entry/34-logmate/
Passiert das auch wenn du ein normales Szenario erstellst?
Also bei normalen Aufgaben habe ich mit über 1.600 Stunden dieses Problem noch nie gehabt. Bei QuickDrive kann es bei 10 erstellten Aufgaben ein bis zweimal passieren. Hänge mal dein Log an, weil so wie Du es beschreibst ist es schon sehr auffällig. Vll. haut ein Asset dazwischen.
PS: Ich muss jedoch auch zugeben, dass bei der Erstellung von QuickDrive ich dies nur für neue Paywarestrecken und ohne zusätzlich aus dem Internet geladene Assets gemacht habe.
Passiert das auch wenn du ein normales Szenario erstellst?
Nein nur wenn ich QD's erstellen möchte, z.B. bei Sibiu - Babeni war es ganz extrem, da konnte ich nicht einen Punkt setzen.
Im Anhang der Log von heute
Ich weiß nicht wie diese ganzen Probleme entstehen. Vielleicht sollte man achtsamer mit den installationen umgehen, sonst könnte sich das zu einem späteren Zeitpunkt rächen.
Der TS will gepflegt werden. 
Genau das gilt es zu erkennen.
