So, ich konnte den Fehler mit der Oberleitung eingrenzen auf eine einzige Datei. Es handelt sich dabei um die Datei: railworks/plugins/GameManager.dll
Die Version in 39.3a ist um ein paar KB kleiner als die in der aktuellesten Version. Es reicht nur die GameManager.dll zu ersetzen und die Oberleitungsmasten funktionieren wieder völlig normal.
Ich packe mal die Datei hier mit dann kann jeder selbst die Datei ersetzen. Probleme oder Abstürze konnte ich keine feststellen in der Verwendung der alten Version, trotzdem gebe ich keine Garantie, dass es bei jeden funktioniert.
http://railworks-austria.at/GameManager.zip
In Steam sollte man jedoch vorerst die automatischen Updates deaktiveren.