Gibt es evtl. etwas wichtiges zu beachten?
Im wesentlichen nicht, kommt drauf an ob Du die Platte geklont hast, oder nur per Backup kopiert hast. Letzters sollte man schauen, ob WIN nicht da was mit den schreibrechten vermurkst hat. 
Sollte nicht passieren, wenn du alles richtig gespeichert hast. Evtl Sicherungsdatei erstellen für die Ordner in denen deine Mods drin sind.
Einfach richtig installiert. So, dass es schonmal funktioniert hat. Meine Wortwahl ist manchmal etwas unklar.
Da ich das auch erst vor kurzem gemacht hab, kann ich dich beruhigen. Das funktioniert problemlos und es geht auch nichts verloren Allerdings habe ich die etwas wilde Methode angewendet und die komplette SteamLibrary mit allen Spielen händisch auf die SSD verschoben und dann die Steam.exe dort gestartet. Diese erkennt dann alles automatisch und setzt die Pfade neu...so einfach kann es einem nur Steam machen 
Ein Backup kann aber vorher nie schaden
und werde ihn von Steam auf die Festplatte Y verschieben lassen
Dann sollte alles IO sein.
