Ich würde die RWa Gleise deinstallieren, den Streckenklon anlegen und die Gleise wieder installieren. Zu der senkrechten Verzerrung rechts: Daran erkenne ich, dass sich da grafisch etwas beißt. Beim Physic patch der HHP8 z.B. hatte ich das auch, oder bei den Milk-run Szenarien der Strecke Portsmouth direct line auch.
Fehlerhafte tracks.bin vom Streckenklon. Das sind die bekannten Fehler bei Verwendung von 3D-Gleisen mit unterschiedlichen Schwellen. Entweder tracks.bin der Originalstrecke aus dem Update von RWA in Streckenklon kopieren oder wie erwähnt Gleise löschen.
Das musst du selbst herausfinden. Kann dir hier keiner sagen, wie dein Klon im Ordner Content/Routes heißt.
Werkzeuge dazu: RW-Tools oder NameMyRoute.exe, Achtung ap-Problem, wenn die Strecke als ap verpackt ist, Routeproperties aus dem ap rausziehen, neben dem Paket im gleichen Ordner ablegen, dann zeigen die Tools auch Strecken-Id und den Streckennamen an.
Okay, vielen Dank!
Und in welchem Pfad ist die tracks.bin Datei zu finden?
siehst du im Streckenmenu des Editors. Wenn du den TS nicht Fullscreen laufen lässt, kannst du da auch gleich per Button den Ordner öffnen. Musst nur noch einen Ordner tiefer nach "Networks".
Das mit den Dateipfaden und dem Networks Ordner habe ich nun kapiert, vielen Dank für die Hinweise!
Leider habe ich es aber vergeigt, da ich die Tracks.bin der Originalstrecke in das Verzeichnis meines Klons kopiert habe und die Datei im Klonverzeichnis ersetzt habe. Nun sind alle Arbeiten meiner von mir selbst erstellten Signalisierung weg....
Aber daran, dass die Signalisierung anscheinend in der Tracks.bin gespeichert ist, habe ich nicht gedacht..... 
Mein Fehler, wahrscheinlich ist es auch klüger, zu Beginn zu schauen, ob der Klon "in Ordnung" ist und keine Texturfehler aufweist und dann erst an der Signalisierung der Strecke zu arbeiten ... 
Musst eh wissen, ob du da was machen willst. Schließlich ist München-Augsburg in der Deluxe-Überarbeitung, wo nicht nur Signale getauscht werden ...
@julian frank ist im TS wie in vielen anderen Situationen auch: wer persönliche Wünsche realisieren / realisiert haben will, muss sich persönlich reinhängen 
